Khu vực với diện tích 426,98 km vuông là nơi có có 1.819 loài thực vật có mạch, 21 loài động vật có vú trên cạn, 394 loài chim, 21 loài lưỡng cư, 36 loài bò sát trên cạn và 267 loài cá, 6.153 loài côn trùng. Khu vực có nhiều loài đặc hữu bao gồm 189 loài thực vật có mạch, 13 loài thú trên cạn, 5 loài chim, 18 loài lưỡng cư, 23 loài bò sát, 14 loài cá, 1.607 loài côn trùng, trong đó đáng chú ý với một số loài quý hiếm và bị đe dọa như thỏ Amami, gà nước Okinawa, mèo Iriomote.[3]

Ngoài ra, ở Yanbaru phía bắc của đảo Okinawa còn là nơi trú ẩn của phường chèo trắng lớn, chào mào tai nâu, cú vọ lưng nâu, cú mèo khoang cổ, chích bụi Nhật Bản, thiên đường đuôi đen, gõ kiến lùn Nhật Bản, bạc má Nhật Bản, vành khuyên Nhật Bản, quạ mỏ lớn, đớp ruồi lưng vàng, cu sen, cuốc ngực nâu, sả hung, bạc má đa sắc. Tuơng tự, các loài được tìm thấy ở Quần đảo Yaeyama (bao gồm cả Iriomote) gồm cu luồng, gõ kiến lùn Nhật Bản.[4]